Sono gli organismi piccolissimi unicellulari che possono vivere all'interno della persona e arrivare dall'esterno. Possono essere sia utili che patogeni.
Fanno parte della microflora intestinale utile. Facilitano la digestione. Sostengono la funzione del sistema immunitario. Producano le vitamine necessarie per l'organismo.
Causano angina, infezioni intestinali, risipola, dissenteria, salmonellosi, tubercolosi, difterite, pertosse, tetano, vari processi infiammatori e purulenti.